A constituição das Comissões Temáticas serve o propósito de coordenar e divulgar atividades dentro dos temas das várias áreas da sua competência. Cada Comissão Temática tem um Coordenador responsável por garantir o seu funcionamento e pessoas singulares que constituem o respetivo painel de especialistas. Este painel é responsável pela emissão de pareceres de posição dentro de cada tema correspondente.
As diferentes Comissões Temáticas procuram a dinamização de parcerias com entidades externas e a promoção de iniciativas conjuntas nas áreas de especialidade correspondente.
No âmbito do ITS Portugal, existem as seguintes Comissões Temáticas e os seus coordenadores:
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